Городская клиническая больница имени А.К. Ерамишанцева является клинической базой следующих научных организаций:

— ГБОУ ВПО «Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России».
Университетская клиника терапевтического профиля . Кафедра госпитальной терапии №1 лечебного факультета Университета.

— ГБОУ ВПО «Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России».
Клиника нефрологии. Кафедра нефрологии и гемодиализа ИПО.

— ГБОУ ВПО «РНИМУ им.Н.И.Пирогова Минздрава РФ».
Клиника неврологии и нейролучевой диагностики . Кафедра фундаментальной и клинической неврологии и нейрохирургии медико-биологического факультета Медицинского университета.

— ФГАОУ ВО РУДН
Клиника травматологии и ортопедии . Кафедра травматологии и ортопедии.

— ФГАОУ ВО РУДН
Клиника эндокринологии . Кафедра эндокринологии ФПК, кафедра госпитальной терапии с курсом клинической лабораторной диагностики.

— ФГАОУ ВО РУДН
Клиника урологии. Кафедра урологии и оперативной нефрологии с курсом онкоурологии медицинского факультета Медицинского института РУДН.

— ГБОУ ВПО «Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России».
Клиника гинекологии. Кафедра акушерства и гинекологии ИПО Университета.

— ГБОУ ВПО «Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России».
Клиника хирургии . Кафедра госпитальной хирургии №1 лечебного факультета.

— ГБОУ ДПО РМАПО Минздрава России.
Клиника анестезиологии и неотложной медицины. Кафедра анестезиологии и неотложной медицины.

— ГБОУ ДПО РМАПО Минздрава России.
Клиника лучевой диагностики. Кафедра рентгенологии и радиотерапии.